“信号塔大战”后，熊大、熊二和光头强的缩小器再度遗失。三人组合继续留守不夜城，找寻缩小器的回家之路更是状况频出，但他们从未放弃希望，最终与小动物们合力拯救小镇，呈现了一场精彩惊险的微观世界冒险之旅。
海蟹游客与泽西海岸的陆蟹镇居民发生冲突。
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一颗陨石从天而降，汪汪队基地惨遭破坏，因祸得福的是，汪汪队通过陨石获得了超能力！变成超能狗狗！能随心飞的天天、有飞毛腿的阿奇、是万人迷的灰灰、会霹雳火的毛毛、成大力士的小砾、不怕风浪的路马……莱德队长还给汪汪队升级了全新的装备，并招募汪汪预备队的三只小狗，共同保护冒险湾！但与此同时，一位邪恶的科学家也盯上了陨石中的超能力，她联合了汪汪队的死对头海丁那市长，试图夺取汪汪队的超能力，并让更多的陨石撞上地球！汪汪队集体出动，勇敢狗狗，不怕困难！汪汪队能否再次拯救世界？
MV（ミュージックビデオ）の制作に没頭する男子高校生・朝屋彼方は、ある日目にしたストリートライブに感動し、その曲のMVを作りたいと強く思う。しかし、歌っていたのは音楽の道を諦めた女性教師・織重夕だった……。
